Een groot deel van ons immuunsysteem wordt aangestuurd vanuit de darmen. Daarnaast worden de darmen ook wel de ‘second brain’ genoemd. Ze zijn namelijk een afspiegeling van de hersenen; ze hebben een twee-weg communicatiesysteem. Om te communiceren worden dezelfde neurotransmitters (signaalstoffen die impulsen doorgeven) gebruikt als in de hersenen. Neem als voorbeeld serotonine, ook wel het gelukshormoon; deze wordt voor 95% aangemaakt in de darmen. Bij een tekort hieraan kun je klachten ervaren in je eetlust, seksuele drift of sociaal gedrag. Maar serotonine speelt ook een rol in de peristaltiek en pijnbeleving van je darmen. Als dit vermindert kan dit tot obstipatie leiden.
Je kan misschien wel begrijpen dat als het microbioom in de darmen verstoord is, dit tot allerlei diverse klachten kan leiden. 

De verbinding tussen je hersenen en je darmen wordt in de eerste levensweken van het embryo en in de eerste 3 levensjaren van het kind als blauwdruk aangemaakt voor het verder optimaal functioneren van de darmen en het immuunsysteem.
In de loop van de jaren kan je microbioom verslechteren door verkeerde/eenzijdige voeding, medicatie, roken, alcohol etc. Om een individueel behandelplan met voeding en supplementen op te stellen, kan er tijdens een consult gekozen worden voor een ontlastingsonderzoek.